Наукові записки НаУКМА. Біологія та екологія

Permanent URI for this community

https://ekmair.ukma.edu.ua/handle/123456789/14703

Періодичне фахове видання "Наукові записки НаУКМА. Біологія та екологія" є друкованим засобом масової інформації, науковим рецензованим журналом відкритого доступу, що оприлюднює статті з біологічної та екологічної проблематики.

Browse

Now showing 1 - 20 of 78

Association of alpha-synuclein co-pathology with beta-amyloid and phosphorylated tau levels in Alzheimer's disease
(2025) Shpylchyn, Vitalii; Vyniavska, Polina
Misfolded α-synuclein (α-syn) aggregates can be present in the cerebrospinal fluid (CSF) of individuals with Alzheimer’s disease (AD), even in the absence of clinical signs of synucleinopathy. This co-pathology may influence AD progression at the molecular level. Detection of α-synuclein aggregates using seed amplification assay (SAA) enables stratification of AD patients beyond classical biomarkers included in the AT(N) framework. The AT(N) framework allows biological classification of AD based on its core pathological processes: β-amyloid aggregation (A), tau accumulation and hyperphosphorylation (T), and non-specific neurodegeneration (N). This study aimed to explore whether α-syn co-pathology, detected by SAA, is associated with altered concentrations and longitudinal trajectories of CSF β-amyloid 42 (Aβ42) and phosphorylated tau 181 (p-tau181) in the biomarker-defined AD group. Data from A+T+ participants (N = 609) in the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) were analysed, using Roche Elecsys electrochemiluminescence immunoassay (ECLIA) and SAA results. Substantial discrepancies between clinical diagnosis and AT profiles were observed. Twenty-nine percent of A+T+ participants were α-synpositive (S+), indicating a high prevalence of α-syn co-pathology in biologically defined AD. Cross-sectional comparisons revealed that S+ individuals had lower baseline Aβ42 concentrations compared to α-synnegative (S−) participants. Linear mixed-effects models (LMEMs) showed a significantly steeper decline in Aβ42 over time in the S+ group, supporting the hypothesis that misfolded α-syn aggregation accelerates amyloid aggregation. However, p-tau181 levels increased more slowly in S+ than in S− individuals, contrary to expectations. These associations remained significant after adjustment for age, sex, diagnosis, and APOE-ε4 genotype. These findings suggest that α-syn co-pathology may affect AD progression through its interaction with Aβ42 and support its integration into biomarker-based classification frameworks.
Astragalus dasyanthus Pall. на території Кіровоградської області: поширення і стан популяцій
(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2026) Чиж, Ольга
У статті наведено результати дослідження хорологічних і ценотичних особливостей та онтогенетичні спектри популяцій Astragalus dasyanthus Pall. у степових ценозах Кіровоградської області. Узагальнено відомості про поширення A. dasyanthus у межах області за даними власних польових досліджень, гербарних фондів Національного ботанічного саду імені М. М. Гришка НАН України (KWHA) та Інституту ботаніки імені М. Г. Холодного НАН України (KW), даних iNaturalist та літературних джерел. На основі цих даних складено загальний список відомих місцезнаходжень та створено картосхему поширення досліджуваного виду в регіоні. За результатами дослідження сучасного поширення на території області проаналізовано 147 локалітетів виду, з яких 73 – за даними iNaturalist, 21 – за літературними джерелами, 20 – за матеріалами гербарних фондів Національного ботанічного саду імені М. М. Гришка НАН України (KWHA) та Інституту ботаніки імені М. Г. Холодного НАН України (KW), 33 – у межах природно-заповідного фонду. За результатами картографічного аналізу з використанням даних карти ПЗФ Кіровоградської області, частина локалітетів, виявлених за іншими джерелами, також розташована на територіях природоохоронних об’єктів або поблизу їхніх меж. Гербарні дані підтверджено новими знахідками, що свідчить про збереження виду на більшості історичних місцезростань. Експедиційні дослідження проводили 05.07.2025 в околиці села Кандаурове Кропивницького району Кіровоградської області, у перехідній зоні між степовою та лісостеповою зонами. Порівняльний аналіз онтогенетичних спектрів двох близько розташованих популяцій показав, що онтогенетичні спектри суттєво різняться залежно від умов місцезростання, що потрібно враховувати під час інтерпретації результатів моніторингу виду. Отримані дані суттєво доповнюють наявні відомості про поширення Astragalus dasyanthus Pall. на території Кіровоградської області та можуть використовуватися для організації моніторингу відомих місцезнаходжень, вивчення стану популяцій і розроблення рекомендацій щодо збереження виду, зокрема обґрунтування розширення наявних і створення нових об’єктів природно-заповідного фонду.
Coinfection of avian pathogenic Escherichia coli and infectious bursal disease virus in broiler chickens
(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2026) Nechypurenko, Oleksii; Furtat, Iryna; Dreval, Denis; Avdeeva, Liliya
Infectious bursal disease virus (IBDV) is the main immunosuppressive agent in the poultry industry that stimulates the development of secondary bacterial infection. However, the avian pathogenic E. coli (APEC) could be a primary agent that induces the development of colibacillosis, nevertheless the absence of immunosuppression. The depletion of bursa after viral replication is crucial for starting bacterial dissemination because of devastation of systemic and local humoral immunity. Therefore, the aim of the work was to investigate the correlation between APEC and IBDV infection in broiler chickens. The bursal atrophy was observed from 21 days with further level depletion from 60 to 90% at the final stage of research. Moreover, APEC strains were isolated from birds at 28–42 days which is correlated with chronical immunosuppression. All E. coli isolates showed resistance to beta‑lactams (amoxicillin, amoxiclav), tetracyclines, and trimethoprim, highlighting the risk of multidrug‑resistant strains. There were no resistant strains to colistin and florfenicol. The IBDV strains were detected in the bursa of 21, 28 and 35 broilers with Ct level 22.8; 25.8; and 32.2 points, respectively that indicates decreasing the viral load. Based on partial nucleotide sequences of the VP2 gene, the pathogen was identified as very virulent United Kingdom 2019 strain. However, analysis of the samples from 42-day-old broilers revealed that the nucleotide sequence belonged to the vaccine strain. Therefore, coinfection of APEC and IBDV in broiler chickens enhances immunosuppression, creating conditions for secondary bacterial infections. The susceptibility to colibacillosis correlates with the stage of bursal depletion and may persist even during replication of the vaccine strain of IBDV after primary infection.
Colibacillosis in broiler chicks and its etiological link to the biological characteristics of Escherichia coli isolates from the breeder flock
(2025) Nechypurenko, Oleksii; Furtat, Iryna; Dreval, Denis; Avdeeva, Liliya
Pathogenic strains of Escherichia coli, capable of causing avian colibacillosis (APEC), currently pose a significant threat to modern poultry farming, in particular industrial broiler production. Moreover, the origin of colibacillosis in broiler chickens is connected with parental health issues. Therefore, the aim of the work was to investigate the etiological link between colibacillosis in 1-day old chicks and the biological characteristics of E. coli isolates from the breeder flock. A total of 65 pathogenic E. coli isolates were detected from broiler-breeders (n = 14) and 1-day-old chikens (n = 51). This shows a huge impact of collibacillosis on poultry farming at different levels of production. The main lesions were associated with fibrin deposition and omphlaitis formation. The last-mentioned parameter could affect the viability of chicks; nevertheless, the average Pasgar score was identified as 9.7 points. Amomg APEC, the most prevalent were O78 and O18 serotypes, wich were characterized by the absence of β-hemolysis. Moreover, the antibiotic profile of APEC isolated from parenteral and progeny flocks was similar. A high level of resistance to amoxicillin, amoxiclav, doxycycline, tetracycline, and enrofloxacin was found; more than 70% of isolated APEC were invulnerable to the mentioned antimicrobials. The most effective antibiotics were colistin, gentamicin, and florfenicol, to which only 0.0% and 2.0%, 14.3 and 9.8%, 7.1% and 2.0% of isolated APEC from broiler-breeders and chickens, respectively, were resistant. In addition, prolonged treatment of birds led to the formation of multi-resistant strains that affected chickens from the first days of life. Thus, studying the process of APEC infection through an integrated production chain can be useful for taking appropriate measures to prevent early cases of colibacilosis.
Cytological research of exophytic tumors of the bronchi and the growth pattern of lung cancer
(2021) Bolgova, Lidiya; Tuganova, Tamara; Ponomarenko, Anna
The study of the growth of lung cancer (LC) has an important clinical significance for morphological verification, the choice of the treatment method, and the determining of prognosis. Investigation of this question allows to clarify the histogenesis of LC. The aim of our study was to compare the results of cytological studies of the material obtained during flexible bronchoscopy (FBS) and scrapings from the operated tumors of the bronchi to clarify the nature of LC growth. Design. To study the growth of tumors in the bronchi in relation to the bronchial mucosa, the cytological examination of the material obtained by FBS and scrapings from the surface of the operated bronchial tumors of 31 patients has been performed. Results. In the preoperative period, in the material of FBS, tumor cells were found only in 1/3 of patients. To obtain the optimal material from exophytic tumors of the bronchus, scrapings were carried out from the entire surface surgical material of the same patients. Cytological preparations of the obtained scrapings confirmed the presence of cancer cells in more than 1/3 of patients. In the rest of the observations, scrapings from the tumor surface contained only cells of the cylindrical epithelium. Conclusions. The cytological investigations made it possible to state that in 2/3 scrapings from surfaces of exophytic tumors of the bronchus contained only cells of the cylindrical epithelium; therefore, the tumors grow under it.
The effectiveness of surfactants as compounds for creating disinfectants with a wide spectrum of action
(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2024) Nechypurenko, Oleksii; Furtat, Iryna; Vakuliuk, Polina; Lemeshko, Valentyna; Vortman, Maryna; Shevchenko, Valerii
Along with the use of antibiotics, the use of disinfectants is crucial in the fighting against multi-resistant strains of bacteria that are dangerous not only for animals but also for humans. A new complex disinfectant could be used as a prevention method. Therefore, the aim of the work was to evaluate the effectiveness surfactants (anionic, cationic and non-ionic) as compounds for the creating of disinfectants with a wide spectrum of action. Compositions with guanidine-containing oligomer (GCO) inhibited S. aureus and C. albicans most effectively. At concentrations of 1000 and 100 ppm, 100 % of cells were inactivated. The biocidal effect against representatives of Gram-negative bacteria was weaker, which should be considered during creation of antimicrobial agents active against pathogenic strains of E. coli. With a rational combination of effective components and their synergism, it is possible to significantly reduce the concentration of the working solution compared to already used commercial disinfectants. For example, the concentration of glutaraldehyde in composition containing 3 % GCO, 1 % Triton X-100, 1 % Trilon B and 1 % glutaraldehyde was in 9 times lower than of Lysoformin 3000. Also, most surfactants used were not characterized by mutagenic activity, which is one of the main criteria for disinfectants usage since this reduces the risks of developing bacterial resistance to antibiotics and other biocides. Thus, the development and implementation of new disinfectants, which could help to fight against multi-resistant strains of bacteria, is an indispensable part of comprehensive programs in controlling and prevention of common diseases in animal husbandry and medicine, particularly, colibacillosis.
Essays on the history of Russian and Ukrainian physiology of the 19th and the beginning of 20th centuries
(2018) Zaporozhets, T.; Sanyk, О.
Many new facts and theories have appeared in physiology. The solution of complex physiological problems required collaboration of physiologists, pathologists, biochemists, biophysicists, mathematicians, and other specialists. That was possible due to the rapid development of new technologies as well as the robust foundation laid by the outstanding physiologists of the 19th century. This article describes the activities of outstanding Russian and Ukrainian physiologists of the 19th and the early 20th centuries. Among them were Ivan Sechenov, Nikolai Vvedenskii, Aleksei Ukhtomskii, Alexandr Samoilov and Ivan Pavlov in Russia, Ivan Shchelkov, Vasyl Danylevskyi, Adolf Beck, Bronislaw Verigo, Alexander Walter, Vasyl Chahovets, and Volodymyr Pravdych-Neminskyi in Ukraine.
Formation of awns in wheat lines with introgressions from Aegilops spp. caused by novel regulatory genes
(2021) Navalikhina, Anastasiia; Antonyuk, Maxym; Shpylchyn, Vitalii; Ternovska, Tamara
Awns play a significant role in the plant physiology and are a well-known morphological marker in wheat. Awnedness in wheat is regulated by three inhibitors – Hd, B1, and B2, but awn promoters are still largely unknown. The present study is aimed at analysis of the expression level of awn development regulatory genes orthologs, TaDL, TaTOB1, TaETT2, and TaKNOX3, in Triticum aestivum, genome substitution amphidiploids AABBSshSsh and AABBUU, and derived lines with introgressions from Aegilops sharonensis and Ae. umbellulata. Expression of four mentioned genes was detected in the lemma of all strains studied, and the role of these genes in awn development was assumed. In awned introgression lines, expression of all studied genes differed from mid-parent value: it was present in parent genotypes and absent in derived lines. Non-additive expression of four studied genes in introgression lines is considered to be the possible reason that caused development of nonparental awned phenotype. The presence of two products resulting from TaTOB1 cDNA amplification, one of which contained fourth intron and another lacking it, is considered to be the result of two mRNA presence due to different TaTOB1 homoeoalleles expression.
Long non-coding RNA SNHG1 as a diagnostic and prognostic marker of bladder cance
(2025) Bratyshchenko, Anastasiia; Haviaz, Volodymyr; Honcharenko, Anton; Stakhovsky, Eduard; Kononenko, Oleksiy; Rosohatska, Inna; Pasichnyk, Tetiana; Mankovska, Oksana
Bladder cancer (BC) is one of the most prevalent cancers globally, and it ranks as the fifth most common malignancy among men in Ukraine. Modern diagnostic tools for bladder cancer have significant limitations: some of them are overly invasive and others lack sufficient sensitivity and specificity. Currently, molecular markers are becoming a promising tool for identification of oncogenic processes. Among epigenetic mechanisms involved in malignant cell transformation, long non-coding RNA (lncRNA)s are of particular interest, as they can act as either oncogenes or tumor suppressors. Available studies suggest that the lncRNA SNHG1, which is currently understudied, promotes tumor proliferation and inhibits apoptosis in malignant cells. The aim of the current study was to analyze changes in the relative expression of SNHG1 in tumor tissues and its levels in cell-free urine of bladder cancer patients, and to evaluate its diagnostic and prognostic value. There was a statistically significant increase in the SNHG1 gene expression level in tumor tissues compared to conditionally normal tissues. Also, a significant decrease in relative levels of SNHG1 transcripts was observed in urine of BC patients compared to healthy individuals. According to the analysis of ROC curves analysis, the chosen marker can identify bladder cancer with high sensitivity and specificity. A positive correlation was also discovered between SNHG1 expression level in tumor tissue and cancer stage. The obtained data support the relevance of further study on lncRNA SNHG1 as a promising diagnostic and prognostic marker of bladder cancer.
Microsatellite Loci Polymorphism in Miguschova Wheat and Common Wheat Cultivars
(2020) Tytenko, Natalia; Iefimenko, Tetiana; Antonyuk, Maksym; Navalikhina, Anastasiia; Shpylchyn, Vitalii; Martynenko, Viktoriia; Pasichnyk, Tetiana
Fusarium head blight is one of the most widespread and dangerous wheat diseases worldwide. Resistance to Fusarium is controlled by some main genes from different Triticinae genomes; however, common wheat has few such resistance genes. Miguschova wheat (Triticum miguschovae Zhir.) with Ab Ab GGDD genome is characterized by the genotype resistant to Fusarium head blight. In order to effectively use it as a source of introgressions to common wheat genome, molecular genetic polymorphisms should be identified, which could later be used for identification of Miguschova wheat introgressions in the common wheat genome. Microsatellite PCR analysis using primers to SSR loci with a known chromosome localization for common wheat identified 14 highly informative loci with specific to Miguschova wheat amplicons, localized on chromosomes of 6 homoeological groups. Seven other SSR loci were identified to have a limited informative value, as DNA of Miguschova wheat did not form any specific PCR product with corresponding primers (null allele). The informative value of those loci was limited to differentiation of wheat cultivars.
Molecular strategies of viral replication and their impact on the evolution of genomes of cellular organisms
(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2026) Hisem, Maksym; Antonyuk, Maksym
The article explores the fundamental role of viruses as generators of genetic variability and driving force of macroevolutionary processes in the biosphere. Molecular biological strategies of virus replication are analyzed within the paradigm of the Baltimore classification, which considers the genome type as а determinant of transcriptional logic and adaptive potential of viral lineages. Attention is focused on enzymatic replication systems – RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and reverse transcriptase (RT), devoid of an error correction mechanism. It is proven that the high frequency of incorporation of noncomplementary nucleotides and structural variability due to template changes lead to the formation of quasispecies – highly dynamic populations of genetically related subvariants, which ensure evolutionary plasticity and survival of the virus under selective pressure. The molecular mechanisms of viral genome integration into host cell chromosomes as а basic pathway of horizontal gene transfer are outlined. Obligate integration of retroviruses mediated by viral integrases with co-optation of cellular proteins for chromatin navigation are considered, as well as the mechanisms of lysogeny of temperate bacteriophages, which determine the genetic plasticity of prokaryotes and their acquisition of new phenotypic traits (in particular, pathogenicity and stress resistance). The phenomenon of the formation of endogenous viral elements (EVE) because of ancient integrations into eukaryotic germline cells, which became а substrate for the emergence of new regulatory sequences, is described. Hypotheses of the origin of viruses are synthesized. The concept of polyphyletic origin is asserted, according to which different viral classes evolved independently from distinct predecessors (plasmids, retrotransposons) through horizontal gene transfer, gene loss, and recombination, which makes it impossible to identify а single common ancestor. The central aspect of the work is the analysis of the consequences of viral-cellular coevolution through the mechanism of molecular exaptation – co-optation of viral genes by host organisms to perform new biological functions. The molecular basis of the formation of morphophysiological structures and immune mechanisms based on integrated viral sequences is presented. Examples are detailed: fusogenic activity of retroviral syncytin proteins during placentation; the origin of the neuronal gene Arc, which provides intercellular communication and synaptic plasticity, from а retrotransposon; the transposon origin of RAGrecombinase enzymes responsible for somatic recombination of gene segments in the vertebrate adaptive immune system; the evolution of the CRISPR-Cas adaptive immune system of bacteria from casposons; the role of endogenous retroviruses in maintaining the pluripotency of embryonic stem cells (HERV-H) and the functioning of their LTR regions as transcriptional enhancers (MER41). It is argued that viruses are а critical architectural element in the formation of genomes and the evolutionary complexity of cellular biological systems.
Significance of introgression hybridization for extension of genetic variability in recipient genome
(2022) Antonyuk, Maksym; Shpylchyn, Vitalii; Martynenko, Viktoriia; Ternovska, Tamara
Alien chromatin (introgressions) can be incorporated into the wheat genome either through recombination or through translocation. Lines of introgressive origin may not contain identified alien chromatin, although they appear to be changed relative to the original wheat sample by some characteristics that are registered at different levels of phenotype assessment. It has been shown numerous facts of the variability of the recipient genome of hybrid origin. They can be caused by irregular behavior of chromosomes in mitoses of somatic cells with hybrid genome, and DNA changes. Wide phenotypic variability was observed among the progeny of hybrid genomes up to appearance of phenotypic novelties. The study of DNA profiles using several methods revealed the presence of numerous genetic and epigenetic changes, including deletions, changes in gene expression, changes in the methylation pattern, and activation of retrotransposons in the recipient genome. When these changes were not directly related to alien fragments, they are considered as possible mechanisms of extension of genetic variability intra genome of hybrid origin. Transcriptomic analysis of lines of hybrid origin and parental plants using the RNA-seq analyses showed that the change of expression affected a different number of genes. The change in the expression of alien genes occurred in the direction of down-regulation, upregulation was typical for wheat genes. Phenotypic variability during introgressive hybridization can be accompanied by attenuation of the expression of an alien gene when it enters the recipient genome. That may be a consequence of the interaction between the alien gene and the genetic environment of the host genome. Today there is a lot of evidence that these mechanisms are epigenetic, which include DNA methylation, histone modification, the involvement of small RNAs in the regulation of gene expression, and the involvement of transposons. Moreover, none of these mechanisms act independently, but are a component of events, the results of which can be a change in gene expression and the appearance of a new phenotype that is not related to the expression of an alien gene.
Variability of gliadin blocks in hybrid derivatives of Migushova wheat and common wheat
(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2026) Plyhun, Viktoriia; Martynenko, Viktoriia; Ternovska, Tamara
The electrophoretic spectra of gliadin components of Triticum miguschоvae Zhir., B1F4 progeny from crossing Migushova wheat (AbAbGGDD) with common wheat varieties Vdala and Panna, winter common wheat varieties T. aestivum L. (AuAuBBDD) Aurora, Vdala, Leleka, Nikonia, Odeska 267, Panna, Selyanka, Tira, were studied. Comparison of the electrophoretic spectra of gliadins of the parent plants that were used to obtain F1 hybrids revealed the presence of differences in some components of the spectrum for both pairs – Migushova wheat x Vdala and Migushova wheat x Panna. For the first crossbreeding combination, 17 components out of 25 were polymorphic for the spectra of the parental plants. For the second crossbreeding combination, 10 out of 27 were polymorphic. In the gliadin spectra of B1F4 grains, a combination of parental components was found, which confirms the hybrid origin of B1F4 grains. In the spectra of F4 grains, polymorphisms that are characteristic for Migushova wheat prevailed. The only exceptions were components 14 and 24, for which the polymorphism “0”, characteristic of the spectrum of the Vdala variety, prevailed. Components 7 and 21 were not present in the spectra of parental plants of both crosses, but they appeared in the electrophoretic spectra of B1F4 descendants. The version of the cross-pollination of hybrids T. miguschovae x T. aestivum had to be rejected due to the complete sterility of such hybrids, known from previous years of work with hybrids of Miguschova wheat and common wheat. That is, components 7 and 21 are the novelty. For hybrids from the crossing of Miguschova wheat with the Panna variety, the tendency of the dominance of the spectrum components characteristic for Miguschova wheat is preserved, although here too there are exceptions: for components 8 and 18, the polymorphism “1” characterizes Panna and it is most often registered in the spectra of grains. In the spectra of hybrids from this cross, the newest components 7 and 21 are also present. Component 21 is found in almost all spectra with rare exceptions. Component 7 is present in the descendants of four out of six F3 hybrids from the crossing of Migushova wheat with Vdala, and among the hybrids with Panna it is present in the spectra of 11 out of 12 F3 hybrids. Other novel components are 26 and 27. They are present in the spectra of B1F4 grains, which originated from a single F3 plant No. 621. It can be assumed that the molecular event that resulted in the appearance of novel components in the gliadin spectrum occurred precisely in this plant. Its F4 descendants can be involved in further studies at the level of nucleotide sequences of gliadin genes to clarify the nature of molecular processes that occur in genomes of hybrid origin and become the source of the emergence of novel traits.
Адвентивні види роду Lonicera (Caprifoliaceae) у флорі Правобережної України
(2020) Шиндер, Олександр; Неграш, Юлія; Глухова, Світлана; Дойко, Наталія; Рак, Олександр
У статті наведено результати вивчення таксономічного складу адвентивних видів роду Lonicera у флорі Правобережної України. Встановлено, що до адвентивних належать широко розповсюджений L. tatarica, рідкісний L. caprifolium і вперше наведені дляфлори України L. × notha іL. ruprechtiana, які локально поширені у спонтанних флорах інтродукційних установ. Зазначено, що L. ruprechtiana потенційно здатний до експансії і тому його не слід рекомендувати до широкого використання в паркових і лісомеліоративних насадженнях. Гібридогенний L. × notha спонтанно виникає в інтродукційних осередках у разі контакту батьківських видів – L. ruprechtiana і L. tatarica, його потенційно висока інвазійна спроможність викликає занепокоєння, а дієвим засобом стримування експансії було б недопущення подальшого поширення L. ruprechtiana в культурі. Виокремлено кілька видів: L. japonica, L. maackii і L. micrantha, – які можуть поповнити адвентивну фракцію флори в майбутньому.
Аналіз однонуклеотидних поліморфізмів у послідовностях генів Pina та Pinb диплоїдних пшениць Triticum monococcum і T. urartu
(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2024) Созінова, Оксана; Блюм, Ярослав
Пуроіндоліни (пуроіндолін а і пуроіндолін b) – низькомолекулярні білки, що визначають текстуру ендосперму зерна видів триб Triticeae та Avenae. Метою цієї роботи був аналіз однонуклеотидних поліморфізмів (SNP) кодуючих послідовностей генів Pina та Pinb диплоїдних пшениць Triticum monococcum (AmAm) і T. urartu (AA) з бази даних NCBI порівняно з референсними послідовностями сорту пшениці м’якої Chinese Spring (CS). З бази даних NCBI було відібрано 62 послідовності гена пуроіндоліну а T. monococcum (Pina-Am1), 22 послідовності Pina T. urartu (Pina-A1), 32 послідовності гена пуроіндоліну b T. monococcum (Pinb-Am1) і 13 послідовностей Pinb T. urartu (Pinb-A1). Як референсні послідовності використовували послідовності гена пуроіндоліну a (алель Pina-D1a) DQ363911.1 сорту CS та гена пуроіндоліну b (алель Pinb-D1a) DQ363913.1 CS з бази даних NCBI. Послідовності вирівнювали з використанням програми MEGA 11. Всього в загальній вибірці 84 послідовностей Pina диплоїдних пшениць ідентифіковано 34 SNP (13 синонімічних відмінностей, 21 несинонімічних, з яких 15 призводять до радикальних амінокислотних замін, 6 – до консервативних), частина з яких спостерігались у всіх послідовностях, а частина були поодинокими. Серед 45 послідовностей Pinb трапляється 36 SNP, але, на відміну від гена Pina, тут переважали синонімічні заміни (22); 7 замін призводили до радикальних амінокислотних замін та ще 7 – до консервативних. Заміни в послідовностях пуроіндолінових генів відносно генів CS можна розподілити на фіксовані в обох видів диплоїдних пшениць, ті, що фіксовані в T. urartu і за якими є поліморфізм у T. monococcum, та специфічні для кожного виду. Виявлено істотні відмінності в частотах трапляння альтернативних нуклеотидів у певних позиціях (81, 318, 322 і 384 Pina та 135 і 359 Pinb) у дикорослої пшениці T. monococcum ssp. aegilopoides і культивованої однозернянки T. monococcum ssp. monococcum.
Антимікробна активність традиційних і новосинтезованих поверхнево-активних речовин як основа створення нових дезінфікувальних засобів
(2022) Фуртат, Ірина; Нечипуренко, Олексій; Вакулюк, Поліна; Вортман, Марина; Шевченко, Валерій
У статті наведено результати дослідження антибактеріальних і фунгіцидних властивостей традиційних та новосинтезованих поверхнево-активних речовин різних класів. А також здійснено порівняльний аналіз антимікробної активності катіонних, аніонних та неіоногенних ПАР для з’ясування можливості подальшого їх застосування для створення дезінфікувальних засобів. На підставі отриманих даних розширено спектр про- та еукаріотичних тест-культур мікроорганізмів, щодо яких може здійснювати біоцидний вплив гуанідинвмісний олігомер. Зважаючи на те, що останній активно пригнічує представників видів Escherichia coli, Salmonella typhimurium, Staphylococcus aureus, а також гриби Candida albicans, цю новосинтезовану ПАР можна вважати перспективною щодо подальшого використання для створення антимікробних засобів широкого спектра дії. На користь перспективності застосування гуанідинвмісного олігомеру як базової сполуки під час створення нових дезінфектантів свідчить широкий спектр антимікробної дії, стійкість під час зберігання, відсутність запаху та відносна простота синтезу.
Біологічні особливості ізолятів роду Fusarium, виділених із зерна Triticum aestivum L., за культивування на середовищах різного складу
(2019) Фуртат, Ірина; Даньшина, Анастасія
У статті наведено результати вивчення деяких біологічних особливостей ізолятів роду Fusarium, виділених із зерна Triticum aestivum L., за умов культивування на середовищах різного хімічного складу. З’ясовано, що останній істотно впливає на культуральні характеристики і швидкість росту виділених ізолятів. Серед досліджених найбільш сприятливим для активного росту ізолятів виявилося напівсинтетичне середовище – картопляно-глюкозний агар. За культивування на синтетичних середовищах культуральні характеристики і ріст є більш стабільними, хоча швидкість росту пригальмовується. Досліджені біологічні особливості ізолятів розширюють спектр характеристик, які в подальшому уможливлюють прогнозування стратегії їхньої поведінки в агроценозах.
Біотопи відділення УСПЗ "Крейдова флора" за національною класифікацією UkrBiotop
(2020) Спінова, Юлія; Чусова, Ольга
Наведено класифікаційну схему біотопів ПЗ "Крейдова флора" (Донецька обл.), яка найбільш детально описує рослинний покрив заповідника. Для визначення біотопів досліджуваної території під час експедицій у різні етапи вегетаційного періоду (з квітня по серпень упродовж 2016–2019 рр.) було проведено геоботанічні описи в усіх частинах заповідника. За результатами власних досліджень, а також аналізу літературних і картографічних джерел [4–7] було сформовано класифікаційну схему біотопів, основою для якої стали класифікації UkrBiotop, розроблені для різних регіонів України.
Взаємодія людини та лісових екосистем Волині в період ІІ Речі Посполитої
(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2026) Мельник, Віктор
На основі аналізу архівних матеріалів Державної дирекції лісів у м. Луцьку періоду Другої Речі Посполитої, що зберігаються в Державному архіві Волинської області, встановлено стан лісових екосистем Волині на той час, динаміку їхніх змін під впливом антропогенних факторів та заходи щодо організації їх охорони. Знищення волинських лісів під час Першої світової війни та інтенсивна експлуатація в період Другої Речі Посполитої у 1918–1939 рр. призвели до зменшення лісистості, деградації лісових екосистем на значних площах, ліквідації та заміни багатьох лісових ділянок рухомими пісками, які наступали на прилеглі лісові масиви та сільськогосподарські угіддя. Антропогенний вплив на лісові екосистеми Волині протягом багатьох століть призвів до зникнення рідкісних видів Dictamnus albus, Helleborus niger, Erythronium dens-canis, Rubus chamaemorus, Arnica montana, Anemone narcissiflora з флори Волині та до деградації популяцій рідкісних видів Daphne cneorum та Neottianthe cucullata. Вирубка лісів та інтенсивне полювання негативно вплинули на стан популяцій не лише рідкісних, а й фонових видів фауни Волині. Популяції лося, рисі та глухаря опинилися під загрозою повного зникнення. У державних лісах Волині в цей період було створено два ботанічні заказники – Карпилівка та Остки на північному сході сучасної Рівненської області для охорони реліктового виду флори Європи рододендрона жовтого (Rhododendron luteum Sweet.). Для збереження місцевої фауни було організовано державний зоологічний бобровий заказник та низку зоологічних резерватів у приватних лісах. Видатні польські вчені та охоронці природи Станіслав Кульчинський, Станіслав Малковський, Стефан Мацко та Владислав Шафер розробили обґрунтування розширення мережі заповідників на Волині, створення Поліського національного парку та «другого Єллоустоуну» в Костопільському повіті, але через Другу світову війну та поділ Польщі ці передові ідеї охорони природи не було втілено в життя.
Види судинних рослин на південній межі ареалу в НПП "Білоозерський" (Київська і Черкаська області): поширення, біотопічна приуроченість та оцінювання загроз
(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2026) Шевчик, Василь; Шиндер, Олександр; Чорна, Галина
У статті проаналізовано групу видів судинних рослин флори НПП "Білоозерський", що перебувають на південній межі ареалу або поблизу неї. Дослідження виконано на основі польових обстежень 2022–2025 рр., літературних джерел, електронних баз даних і багаторічних авторських спостережень у Середньому Придніпров’ї. Встановлено, що із 684 аборигенних видів парку 62 види (9,1 %) належать до гранично-ареальної групи. Серед них переважають бореальні види, а найбільше місцезростань пов’язано з болотними, сирими лісовими, лучними та іншими зволоженими біотопами борової тераси. Серед досліджених видів більшість – 24 (38,7 %) – належать до бореального геоелементу флори. Значно менше представлені європейські – 14 (22,6 %), голарктичні – 9 (14,5 %) та євразійські – 7 (11,3 %) види. Це підкреслює екстразональний характер зростання бореальних видів на території НПП "Білоозерський" та надає флорі парку загалом значного бореального характеру. Серед гранично-ареальних видів флори парку переважають рослини біотопів, приурочених до надмірно чи добре зволожених знижень борової тераси, зокрема: мезотрофних осокових, чагарникових та лісових боліт (D2; G1.121–122; G1.131), світлих, свіжих та вологих дрібнолистяних суходільних лісів на середньобагатих та бідних підзолистих ґрунтах (G1.123–124) та свіжих соснових лісів зеленомохових (G2.214). Серед видів цієї еколого-ценотичної групи переважну більшість становлять типові бореальні види (21). Значно меншою кількістю представлені голарктичні (5), європейські (4) та євразійські (2) види. Показано, що 33 види мають охоронний статус різного рівня. Для популяцій у межах парку виконано оцінювання загроз за критеріями, наближеними до підходів Міжнародного союзу охорони природи (МСОП). Встановлено, що 13 видів належать до категорії LC, 32 – NT, 10 – VU, 2 – EN і 5 – CR. Найуразливішими є популяції видів із вузькою біотопічною приуроченістю, малою чисельністю та ослабленим репродуктивним відновленням. Критичну загрозу (CR) у межах парку встановлено для 5 видів: Agrimonia pilosa, Lilium martagon, Lycopodium annotinum, Peucedanum cervaria і Pyrola minor. Обґрунтовано необхідність локальних природоохоронних заходів і моніторингу таких популяцій.

Browse

Browsing Наукові записки НаУКМА. Біологія та екологія by Title

Results Per Page

Sort Options