Browse
Recent Submissions
Item Мінливість геномів інтрогресивних ліній Triticum aestivum(2025) Плигун, Вікторія; Антонюк, Максим; Єфіменко, Тетяна; Терновська, ТамараІнтрогресивну гібридизацію використовують для покращення гексаплоїдної пшениці, яка культивується, за агрономічно-важливими ознаками, серед яких стійкість до патогенів. Відбувається залучення генетичної різноманітності близькоспоріднених видів пшениці, дикорослих родичів (King et al., 2022). Поєднання в одному ядрі послідовностей різного походження (пшеничного та від геному-донора бажаної ознаки) спричиняє геномну нестабільність або геномний / гібридний шок. Рівень нестабільності залежить від рівня відмінностей геномів донора та реципієнта. Проявами є активація мобільних генетичних елементів, хромосомні перебудови через події рекомбінації, зміна експресії генів та інші (Glombik et al., 2020). Через такі події відбувається стабілізація гібридного геному, яка може сприяти втраті цільової ознаки. Тому має бути контроль передачі послідовностей інтересу через використання доступних молекулярно-генетичних підходів. Для роботи використано геномно-заміщений амфідиплоїд Авротіка (ААВВТТ, 2n=6x=42), його гексаплоїдні інтрогресивні лінії T. aestivum/Am. muticum (серія tica), створені у 2014 році (Iefimenko et al., 2015).Item Evaluation of correlation between STR markers standardized for dog identification and phenotypic traits(Галич-Прес, 2025) Shevchuk, Karyna; Plyhun, Viktoriia; Antonyuk, MaksymThe domestic dog (Canis lupus familiaris) is one of the most morphologically variable mammals and serves as an exceptionally intriguing model for exploring selection pathways. Research into its genetics is crucial for understanding the mechanisms of phenotypic trait inheritance, breed history, and the development of modern identification methods. Thanks to molecular genetic markers—particularly short tandem repeats (STRs)—it has become possible to distinguish individual animals and breeds effectively. This capability is actively utilized in studies of the genetic structure of dog populations, in the analysis of congenital disorders, forensic science, and canine breeding practices.Item Аналіз мейозу у гібридів пшениці м'якої з інтрогресіями від Amblyopirum muticum(Галич-Прес, 2025) Плигун, Вікторія; Антонюк, Максим; Єфіменко, Тетяна; Терновська, ТамараПеренесення генів стійкості до грибних патогенів у геноми гексаплоїдної пшениці м’якої може відбуватися через пряму гібридизацію з близькоспорідненими видами, однак так може виникати стерильність гібридів, аномальна кон’югація хромосом у мейозі. Альтернативним є створення амфідиплоїдів, які поєднують геноми пшениці м’якої та дикорослих видів (Song, 2024). За допомогою амфідиплоїдів створюють інтрогресивні лінії, які мають різну кількість генетичного матеріалу чужинного походження. Лінійний матеріал залучають у схрещування з комерційними сортами пшениці м’якої (King, 2022). Успішність передачі бажаної ознаки залежить від споро- та гаметогенезу (Crespo-Herrera, 2017).Item Мінливість консервативних районів генів стійкості до патогенів у представників Triticeae(Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України, 2025) Плигун, Вікторія; Антонюк, Максим; Єфіменко, Тетяна; Терновська, ТамараОдним з факторів, який забезпечує стійкість рослин до патогенів є гени стійкості R, які мають консервативні послідовності, представленість яких та нуклеотидний склад варіюють. Одні і ті ж гени R можуть залучатися в розвиток стійкості до різних збудників захворювань. Одним з патогенів злаків є борошниста роса, збудником якої у пшениці м’якої є Blumeria graminis f. sp. tritici (Bgt), стійкість до якої забезпечують гени Pm (Fu et al., 2015). Через поліплоїдний статус гексаплоїдна пшениця може мати декілька копій послідовностей, які пов’язують зі стійкістю, та приймати до свого геному чужинний хроматин через інтрогресивну гібридизацію. Зміна нуклеотидного складу генів R може бути пов’язана з втратою чи набуттям стійкості (Hussain et al., 2024). Вивчення структури генів R та пошук зв’язку між цими змінами та проявом ознаки дозволить наблизитись до розуміння втрати стійкості у генотипів гібридного походження.Item Введення в культуру in vitro рослин гіркокаштана звичайного (Aesculus hippocastanum)(Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України, 2025) Кваско, Анна; Бередніченко, Олена; Мельничук, Олександр; Ємець, АллаЗ метою розробки ефективного протоколу введення в культуру рослин гіркокаштана було проведено дослідження з застосуванням різних схем стерилізації експлантів. Рослинний матеріал було отримано з дерева каштана, що проростає на території Національного університету біоресурсів і природокористування України (НУБіП).Item Консервативні ділянки генів стійкості як джерело нуклеотидних поліморфізмів у дослідженні гексаплоїдів пшеницi(2025) Плигун, Вікторія; Антонюк, Максим; Терновська, ТамараДослідження виконано для ідентифікації пар праймерів до консервативних ділянок генів стійкості R до борошнистої роси та інших патогенів пшениці, ефективних для виявлення поліморфізму у спектрах ампліконів між зразками, контрастними за стійкістю до борошнистої роси. Стійкими зразками були амфідиплоїд Авротіка (геном ААВВТТ) і створені на його основі лінії пшениці (ААВВDD). Виявлення поліморфних компонентів спектрів дасть змогу використовувати відповідні пари праймерів для оцінювання перспективності сучасних сортів пшениці м ’якої бути реципієнтом гена (генів) стійкості, що може бути переданий від Авротіки до генетичного пулу пшениці м ’якої через статеву гібридизацію. Метод дослідження — ПЛР на геномній ДНК досліджених генотипів з застосуванням пар праймерів, розроблених з використанням послідовностей нуклеотидів у консервативних ділянках генів стійкості до борошнистої роси, а також вироджених праймерів до консервативних ділянок різних генів стійкості для довільного комбінування їх в пари за методом RGAR. Показано, що використання метода RGAR дає більше інформації про наявний поліморфізм в досліджених геномах у порівнянні з використанням праймерів до консервативних послідовностей генів Pm. Найбільшу варіабельність спостерігали з праймерами, створеними до ділянок, що кодують LLR-домени білків стійкості. їх можна використовувати в комбінаціях з іншими праймерами за методом RGAR, для збільшення кількості ефективних ПЛР-маркерів генів стійкості.Item Antibacterial properties of composite materials based on metal/metal-oxide nanoparticles, nanosilica and polylactid acid(2025) Bespalko, Oleksandr; Vakuliuk, Polina; Furtat, Iryna; Pryshchepa, Oleksandra; Kozakevych, Roman; Pomastowskі, PawełThe global rise in antimicrobial resistance necessitates the development of alternative materials with effective antibacterial properties. This study compares two classes of nanocomposites: silver nanoparticle (AgNP)- and zinc oxide (ZnO)-based systems, both immobilized on silica (SiO₂) and treated with polylactic acid (PLA) to enhance biocompatibility and biodegradability. AgNP-containing composites (SiO₂- Ag and SiO₂-Ag-PLA) exhibited potent, broad-spectrum antibacterial activity, particularly against Gram-negative E. coli and K. pneumoniae, though activity decreased when modified with PLA—likely due to reduced ion release and surface coverage interference.Item Synthesis of Tinidazole-Based Nanocomposites and Evaluation of Their Physicochemical Properties(2025) Avramenko, Viktoriia; Vakuliuk, Polina; Furtat, Iryna; Pryshchepa, Oleksandra; Melnykov, V.; Murlanova, Tetiana; Pomastowskі, Paweł; Smarsly, BerndThe aim of the study was to obtain NCs based on nanosilica capable of improving the properties of tinidazole and increasing the safety of its use.Item Antibacterial properties of silver-containing composite materials based on silica and polylactic acid(2025) Bespalko, Oleksandr; Vakuliuk, Polina; Furtat, Iryna; Pryshchepa, Oleksandra; Kozakevych, Roman; Pomastowskі, PawełThis study aimed to investigate composite materials containing silver nanoparticles (AgNPs) impregnated on silica (SiO2) and incorporated into a polylactic acid (PLA) matrix.Item Study of guanidine-containing oligomer for desinfectant application(2025) Hodlevskyi, H.; Hudyma, A.; Vakuliuk, Polina; Pryshchepa, Oleksandra; Furtat, Iryna; Vortman, Maryna; Fijalkowski, Pawel; Rafińska, K.; Lemeshko, Valentyna; Murlanova, Tetiana; Smarsly, Bernd; Pomastowskі, Paweł; Shevchenko, V.The purpose of this project is a creation of guanidine containing oligomer, that could be used as a disinfectant against multiresistant microorganisms.Item Physicochemical and antibacterial properties of ornidazole based nanocomposites for medical application(2025) Avramenko, Viktoriia; Vakuliuk, Polina; Furtat, Iryna; Pryshchepa, Oleksandra; Kozakevych, Roman; Demianenko, Eugeniy; Murlanova, Tetiana; Smarsly, Bernd; Pomastowskі, PawełThis study analyzed nanocomposites with ornidazole – an antimicrobial agent effective against anaerobic bacteria and protozoa.Item Зоологія безхребетних у презентаціях [електронний ресурс] : навчальний посібник(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2025) Пасічник, СергійУ навчальному посібнику розглянуто системи тваринного світу. Розкрито сучасний стан зоологічної науки, її місце серед біологічних дисциплін і значення серед фундаментальних і прикладних біологічних наук. Основний об’єкт – це безхребетні тварини, а саме план будови та рівні організації, життєві цикли розвитку, біологічні особливості, місце в екосистемах, розповсюдження, походження та філогенетичні зв’язки головних таксономічних одиниць, закономірності індивідуального та історичного розвитку. Представлено сучасну систематику безхребетних тварин. Розглянуто специфіку проявів загальнобіологічних законів на прикладі безхребетних тварин, порівняльні анатомо-морфологічні особливості систем органів і головні риси їхньої еволюції, роль у біосфері, житті та господарській діяльності людини. Інформацію подано у формі презентацій (Microsoft PowerPoint). Посібник містить зображення з відкритих джерел. Для студентів закладів вищої освіти, які слухають зоологічні курси, та викладачів практичних курсів із зоології безхребетних.Item Зоологія хордових у презентаціях [електронний ресурс] : навчальний посібник(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2025) Пасічник, Сергій; Пасічник, ТетянаНавчальний посібник охоплює основні питання зоології хордових. Окреслено місце цієї науки серед біологічних дисциплін та її значення серед фундаментальних і прикладних біологічних наук. Наведено новітні принципи зоологічної систематики. Розглянуто значення хордових тварин у підтриманні стійкості та пружності основних типів екосистем; загальні риси, властиві всім хордовим тваринам, обсяг типу Хордових, його систематику, походження та філогенетичні зв’язки головних таксономічних одиниць, специфіку прояву загальнобіологічних законів на прикладі хордових тварин, порівняльні анатомо-морфологічні особливості систем органів і головні риси їхньої еволюції, загальні особливості екології та поширення. Інформацію подано у формі презентацій (Microsoft PowerPoint). Посібник містить зображення з відкритих джерел. Для студентів закладів вищої освіти, які слухають зоологічні курси, та викладачів практичних курсів із зоології хордових.Item Antibacterial properties of zinc oxide-containing composite materials based on silica and polylactic acid(ЛНУ імені Івана Франка, 2025) Bespalko, Oleksandr; Vakuliuk, Polina; Furtat, Iryna; Pryshchepa, Oleksandra; Kozakevych, Roman; Pomastowski, PawełAntimicrobial resistance poses a critical threat to global health, as conventional drugs increasingly fail against multidrug-resistant pathogens. A key challenge lies in the inability of many antimicrobials to penetrate microbial membranes or act effectively against intracellular infections. Nanoparticles (NPs) offer a promising alternative due to their unique physicochemical properties and broad-spectrum antimicrobial activity. Among these, zinc oxide nanoparticles (ZnO NPs) are especially notable for their low cytotoxicity and effectiveness against resistant strains.Item Long non-coding RNA SNHG1 as a diagnostic and prognostic marker of bladder cance(2025) Bratyshchenko, Anastasiia; Haviaz, Volodymyr; Honcharenko, Anton; Stakhovsky, Eduard; Kononenko, Oleksiy; Rosohatska, Inna; Pasichnyk, Tetiana; Mankovska, OksanaBladder cancer (BC) is one of the most prevalent cancers globally, and it ranks as the fifth most common malignancy among men in Ukraine. Modern diagnostic tools for bladder cancer have significant limitations: some of them are overly invasive and others lack sufficient sensitivity and specificity. Currently, molecular markers are becoming a promising tool for identification of oncogenic processes. Among epigenetic mechanisms involved in malignant cell transformation, long non-coding RNA (lncRNA)s are of particular interest, as they can act as either oncogenes or tumor suppressors. Available studies suggest that the lncRNA SNHG1, which is currently understudied, promotes tumor proliferation and inhibits apoptosis in malignant cells. The aim of the current study was to analyze changes in the relative expression of SNHG1 in tumor tissues and its levels in cell-free urine of bladder cancer patients, and to evaluate its diagnostic and prognostic value. There was a statistically significant increase in the SNHG1 gene expression level in tumor tissues compared to conditionally normal tissues. Also, a significant decrease in relative levels of SNHG1 transcripts was observed in urine of BC patients compared to healthy individuals. According to the analysis of ROC curves analysis, the chosen marker can identify bladder cancer with high sensitivity and specificity. A positive correlation was also discovered between SNHG1 expression level in tumor tissue and cancer stage. The obtained data support the relevance of further study on lncRNA SNHG1 as a promising diagnostic and prognostic marker of bladder cancer.Item Association of alpha-synuclein co-pathology with beta-amyloid and phosphorylated tau levels in Alzheimer's disease(2025) Shpylchyn, Vitalii; Vyniavska, PolinaMisfolded α-synuclein (α-syn) aggregates can be present in the cerebrospinal fluid (CSF) of individuals with Alzheimer’s disease (AD), even in the absence of clinical signs of synucleinopathy. This co-pathology may influence AD progression at the molecular level. Detection of α-synuclein aggregates using seed amplification assay (SAA) enables stratification of AD patients beyond classical biomarkers included in the AT(N) framework. The AT(N) framework allows biological classification of AD based on its core pathological processes: β-amyloid aggregation (A), tau accumulation and hyperphosphorylation (T), and non-specific neurodegeneration (N). This study aimed to explore whether α-syn co-pathology, detected by SAA, is associated with altered concentrations and longitudinal trajectories of CSF β-amyloid 42 (Aβ42) and phosphorylated tau 181 (p-tau181) in the biomarker-defined AD group. Data from A+T+ participants (N = 609) in the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) were analysed, using Roche Elecsys electrochemiluminescence immunoassay (ECLIA) and SAA results. Substantial discrepancies between clinical diagnosis and AT profiles were observed. Twenty-nine percent of A+T+ participants were α-synpositive (S+), indicating a high prevalence of α-syn co-pathology in biologically defined AD. Cross-sectional comparisons revealed that S+ individuals had lower baseline Aβ42 concentrations compared to α-synnegative (S−) participants. Linear mixed-effects models (LMEMs) showed a significantly steeper decline in Aβ42 over time in the S+ group, supporting the hypothesis that misfolded α-syn aggregation accelerates amyloid aggregation. However, p-tau181 levels increased more slowly in S+ than in S− individuals, contrary to expectations. These associations remained significant after adjustment for age, sex, diagnosis, and APOE-ε4 genotype. These findings suggest that α-syn co-pathology may affect AD progression through its interaction with Aβ42 and support its integration into biomarker-based classification frameworks.Item Colibacillosis in broiler chicks and its etiological link to the biological characteristics of Escherichia coli isolates from the breeder flock(2025) Nechypurenko, Oleksii; Furtat, Iryna; Dreval, Denis; Avdeeva, LiliyaPathogenic strains of Escherichia coli, capable of causing avian colibacillosis (APEC), currently pose a significant threat to modern poultry farming, in particular industrial broiler production. Moreover, the origin of colibacillosis in broiler chickens is connected with parental health issues. Therefore, the aim of the work was to investigate the etiological link between colibacillosis in 1-day old chicks and the biological characteristics of E. coli isolates from the breeder flock. A total of 65 pathogenic E. coli isolates were detected from broiler-breeders (n = 14) and 1-day-old chikens (n = 51). This shows a huge impact of collibacillosis on poultry farming at different levels of production. The main lesions were associated with fibrin deposition and omphlaitis formation. The last-mentioned parameter could affect the viability of chicks; nevertheless, the average Pasgar score was identified as 9.7 points. Amomg APEC, the most prevalent were O78 and O18 serotypes, wich were characterized by the absence of β-hemolysis. Moreover, the antibiotic profile of APEC isolated from parenteral and progeny flocks was similar. A high level of resistance to amoxicillin, amoxiclav, doxycycline, tetracycline, and enrofloxacin was found; more than 70% of isolated APEC were invulnerable to the mentioned antimicrobials. The most effective antibiotics were colistin, gentamicin, and florfenicol, to which only 0.0% and 2.0%, 14.3 and 9.8%, 7.1% and 2.0% of isolated APEC from broiler-breeders and chickens, respectively, were resistant. In addition, prolonged treatment of birds led to the formation of multi-resistant strains that affected chickens from the first days of life. Thus, studying the process of APEC infection through an integrated production chain can be useful for taking appropriate measures to prevent early cases of colibacilosis.Item Silica-based Spheres Enriched with Sulfur- and Nitrogen-containing Groups: Transitioning from Adsorbents to Sensory Applications(2024) Stoliarchuk, Nataliia; Tomina, Veronika; Kyshkarova, Viktoriia; Furtat, Iryna; Semeshko, Olha; Seisenbaeva, Gulaim; Melnyk, InnaThe chemical properties at the surface of silica-based materials play a pivotal role in their application effectiveness. The characteristics, positioning, and mixture of surface functional groups directly influence the adsorption properties of these materials. Through a singular synthesis process, it’s possible to create functionalized silica spheres, paving the way for the development of sorbents that are highly efficient in cleaning wastewater from the metallurgy and textile industries or in the precise extraction of precious metals from discarded electronic components.Item Мінливість послідовностей низки генів Pm у представників TRITICEAE(2024) Плигун, Вікторія; Антонюк, МаксимМета. Співставлення послідовностей відібраних генів стійкості, розміщених у GenBank, для пошуку типів відмінностей у їхньому нуклеотидному складі та визначення значущості цих відмінностей при створенні праймерів. Методи. Пошук послідовностей проводили у біологічній базі даних GenBank. Порівняння різних сиквенсів одного і того ж гену здійснювали у DnaSP6 через розрахунок критерію Тадзіми для Pm2, Pm3 та критерію Колмогорова-Смірнова у GeneDoc для Pm21. Множинне вирівнювання зробили у CLUSTALW перед тим як працювати у зазначених програмах. Розробляли праймери у Primer3. Результати. Варіабельність порівнюваних послідовностей є у нуклеотидних замінах, інсерціях / делеціях, наявності транспозону в одній з послідовностей Pm3. Найбільш варіабельними є ділянки, які кодують повтори, багаті на лейцин. Послідовності, ізольовані з Triticum dicoccoides, мають дві такі ділянки, в межах кожної деякі зі змін у нуклеотидній послідовності відображатимуться на амінокислотному складі білків. Висновки. Відмінності між порівнюваними послідовностями Pm2, Pm3, Pm21 (у межах кожного з генів) є випадковими (р < 0,05). За результатами вивчення сиквенсів створені комбінації праймерів для ідентифікації послідовностей, характерних для генів стійкості, на доступному рослинному матеріалі.Item Гуанідинійвмісні аліфатичні олігомери з бактерицидною активністю(Інститут хімії високомолекулярних сполук НАН України, 2024) Вортман, Марина; Фуртат, Ірина; Вакулюк, Поліна; Лемешко, Валентина; Пилипенко, Андрій; Шевченко, ВалерійРозроблено метод синтезу реакційноздатних аліфатичних гідрохлоридних гуанідинієвих олігомерів (ГО) різної ММ реакцією олігомерного оксіалкілаліфатичного діепоксиду з гуанідином за змінного співвідношення вихідних компонентів з подальшою нейтралізацією отриманого продукту соляною кислотою. Синтезовані олігомери являють собою дифільні біанкерні поверхнево-активні речовини з жорсткими гуанідиновими фрагментами на кінцях ланцюга. Характерною особливістю будови ГО є їхня амфіфільність, спричинена наявністю гідроксивмісних гуанідинієвих фрагментів як на кінцях, так і всередині ланцюга. Хімічну будову ГО охарактеризовано методами ІЧ-, 1Н-ЯМР спектроскопії. Досліджено бактерицидні властивості аліфатичних гуанідинієвих олігомерів щодо низки грампозитивних і грамнегативних бактерій залежно від ММ ГО. Визначено мінімальну пригнічувальну концентрацію аліфатичних гуанідинієвих олігомерів щодо досліджуваних штамів бактерій. Показано, що найбільшу бактерицидну активність і, відповідно, найменшу мінімальну пригнічувальну концентрацію щодо грампозитивних і грамнегативних бактерій має олігомер з низькою ММ. Крім того, притаманна синтезованим ГО реакційна здатність робить їх перспективними реагентами для отримання нових типів полімерів і композиційних матеріалів на їх основі.