Виявлення метилювання генів VIM, TMEFF2 і GDF15 у сечі пацієнтів, хворих на рак сечового міхура, в українській популяції

dc.contributor.authorМаньковська, Оксана
dc.contributor.authorСкрипнікова, О.
dc.contributor.authorПанасенко, Г.
dc.contributor.authorВікарчук, М.
dc.contributor.authorКононенко, О.
dc.contributor.authorСтаховський, Е.
dc.contributor.authorКашуба, В.
dc.date.accessioned2016-11-17T06:56:59Z
dc.date.available2016-11-17T06:56:59Z
dc.date.issued2016
dc.descriptionBladder cancer is one of the most common cancers in Ukraine and in the world, and the problem of its early diagnosis is still unresolved. The use of epigenetic markers, namely, the detection of tumor suppressor genes methylation, is a promising tool to assess the risks of the disease and its early detection, but it has a population features. The aim of this study was to test whether methylation of genes GDF15, TMEFF2 and VIM appears in the urine of patients with bladder cancer in the Ukrainian population, and evaluate the potential of this combination of methylated genes as tumor markers. We collected urine from patients with bladder (sample size is n = 42) and used urine samples from 5 healthy people as negative control. DNA was precipitated by CTAB and isolated by using a standard phenol/ chloroform/isopropanol approach. The presence of methylation of VIM, TMEFF2 and GDF15 promoters was detected by Real-Time MSP PCR after the procedure of DNA bisulfite conversion. We found the presence of hypermethylation of all 3 genes among the studied patients (n = 42), while none was detected in samples taken from healthy people (n = 5). The sensitivity of this potential combination of markers was 69 %, with specificity of 100 %. Correspondence between tumor stage and presence or absence of any of the studied markers has not been identified. It was concluded that there is a necessity to increase the sample size and to test the capability of GDF15, TMEFF2 and VIM to distinguish between bladder cancer and other onco-urological diseases.en
dc.description.abstractРак сечового міхура є одним із найпоширеніших в Україні та світі, проблема його ранньої діагностики досі є нерозв’язаною. Використання епігенетичних маркерів, а саме виявлення метилування генів-онкосупресорів, є перспективним засобом для оцінки ризиків цього захворювання і раннього його виявлення, проте має популяційні особливості. Метою цієї роботи було перевірити, чи виявляється метилування генів GDF15, TMEFF2 і VIM у сечі хворих на рак сечового міхура в українській популяції і чи можна застосовувати цю комбінацію метильованих генів як інформативну панель онкомаркерів. Ми виявили наявність метилування усіх трьох генів серед досліджуваних хворих (n = 42), при цьому жоден не детектувався у нормі (n = 5). Чутливість цієї комбінації потенційних маркерів становила 69 %, специфічність – 100 %. Було зроблено висновок про необхідність розширення вибірки і перевірки диференціювальної здатості GDF15, TMEFF2 і VIM для раку сечового міхура порівняно з іншими онкоурологічними патологіями.uk
dc.identifier.citationВиявлення метилювання генів VIM, TMEFF2 і GDF15 у сечі пацієнтів, хворих на рак сечового міхура, в українській популяції / Маньковська О. С., Скрипнікова О. C., Панасенко Г. В., Вікарчук М. В., Кононенко О. А., Стаховський Е. О., Кашуба В. І. // Наукові записки НаУКМА : Біологія та екологія. - 2016. - Т. 184. - С. 23-29.uk
dc.identifier.urihttps://ekmair.ukma.edu.ua/handle/123456789/9819
dc.language.isoukuk
dc.relation.sourceНаукові записки НаУКМА: Біологія та екологіяuk
dc.statuspublished earlieruk
dc.subjectметилуванняuk
dc.subjectгени-онкосупресориuk
dc.subjectрак сечового міхураuk
dc.subjectрання діагностикаuk
dc.subjectонкомаркериuk
dc.subjectGDF15en
dc.subjectTMEFF2en
dc.subjectVIMen
dc.subjectmethylationen
dc.subjecttumor suppressor genesen
dc.subjectbladder canceren
dc.subjectearly diagnosisen
dc.subjecttumor markersen
dc.titleВиявлення метилювання генів VIM, TMEFF2 і GDF15 у сечі пацієнтів, хворих на рак сечового міхура, в українській популяціїuk
dc.title.alternativeDetection of methylation of VIM, TMEFF2 and GDF15 in the urine of patient with bladder cancer in Ukrainian populationen
dc.typeArticleuk
Files
Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Mankovska_Vyiavlennia_metyliuvannia_heniv.pdf
Size:
324.99 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
License bundle
Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
7.54 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: