Консервативні ділянки генів стійкості як джерело нуклеотидних поліморфізмів у дослідженні гексаплоїдів пшеницi
Loading...
Date
2025
Authors
Плигун, Вікторія
Антонюк, Максим
Терновська, Тамара
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Дослідження виконано для ідентифікації пар праймерів до консервативних ділянок генів стійкості R до борошнистої роси та інших патогенів пшениці, ефективних для виявлення поліморфізму у спектрах ампліконів між зразками, контрастними за стійкістю до борошнистої роси. Стійкими зразками були амфідиплоїд Авротіка (геном ААВВТТ) і створені на його основі лінії пшениці (ААВВDD). Виявлення поліморфних компонентів спектрів дасть змогу використовувати відповідні пари праймерів для оцінювання перспективності сучасних сортів пшениці м ’якої бути реципієнтом гена (генів) стійкості, що може бути переданий від Авротіки до генетичного пулу пшениці м ’якої через статеву гібридизацію. Метод дослідження — ПЛР на геномній ДНК досліджених генотипів з застосуванням пар праймерів, розроблених з використанням послідовностей нуклеотидів у консервативних ділянках генів стійкості до борошнистої роси, а також вироджених праймерів до консервативних ділянок різних генів стійкості для довільного комбінування їх в пари за методом RGAR. Показано, що використання метода RGAR дає більше інформації про наявний поліморфізм в досліджених геномах у порівнянні з використанням праймерів до консервативних послідовностей генів Pm. Найбільшу варіабельність спостерігали з праймерами, створеними до ділянок, що кодують LLR-домени білків стійкості. їх можна використовувати в комбінаціях з іншими праймерами за методом RGAR, для збільшення кількості ефективних ПЛР-маркерів генів стійкості.
Description
The study was performed to identify primer pairs to conserved regions of R resistance genes to powdery mildew and other wheat pathogens effective in detecting polymorphism in amplicon spectra between samples contrasting in powdery mildew resistance. The resistant samples were the amphidiploid Aurotica (AABBTT genome) and wheat lines developed on its basis (AABBBDD). Detection of polymorphic components of spectra will make it possible to use appropriate primer pairs to assess the prospects of modern varieties of common wheat to be a recipient of the resistance gene(s) that can be transferred from Aurotica to the genetic pool of common wheat through sexual hybridization. The research method is PCR on genomic DNA of the studied genotypes using primer pairs developed using nucleotide sequences in conserved regions of powdery mildew resistance genes, as well as degenerate primers to conservative regions of different resistance genes for arbitrary pairing of them using the RGAP method. The use of the RGAP method was shown to provide more information about the polymorphism present in the studied genomes compared to the use of primers to conserved sequences of Pm genes. They can be used in combinations with other RGAP primers to increase the number of effective PCR markers of resistance genes.
Keywords
інтрогресивні лінії, Amblyоруrum mutisum, пшениця м ’яка, стійкість до борошнистої роси, гени стійкості, метод RGAP, ПЛР-маркери, стаття
Citation
Плигун В. В. Консервативні ділянки генів стійкості як джерело нуклеотидних поліморфізмів у дослідженні гексаплоїдів пшеницi / Плигун В. В., Антонюк М. З., Терновська Т. К. // Цитологія і генетика. – 2025. – Т. 59, № 4. – С. 3-14.