Рівень поліморфізму та диференціація популяцій Iris pumila L. за даними трьох типів ПЛР-маркерів

Simple item page
dc.contributor.authorБублик, О. М.
dc.contributor.authorПарнікоза, Іван
dc.contributor.authorКунах, В.
dc.date.accessioned2021-04-14T23:10:47Z
dc.date.available2021-04-14T23:10:47Z
dc.date.issued2021
dc.description.abstractГенетичний поліморфізм рідкісного селекційно і декоративно цінного виду Iris pumila досліджено за до- помогою ПЛР-аналізу з праймерами трьох типів: на основі мікросателітних послідовностей (ISSR), послідовностей МГЕ (IRAP та iPBS) та генів відповіді на абіотичний стрес (LP-PCR). Виявлено високий рівень внутрішньовидового та внутрішньопопуляційного генетичного поліморфізму, який не поступався значенням інших видів роду Iris. Основні показники генетичного поліморфізму п ’яти популяцій І. pumila з території України склали: частка поліморфних локусів (Р) — 26,5—68,5 %, індекс Шеннона (S) — 0,105—0,285, генне різноманіття (Н ) — 0,069—0,190. Залежність рівня мінливості від розміру популяції була прямою у ISSR-аналізі і оберненою за даними інших двох маркерів. Пряму залежність генетичних та географічних дистанцій між популяціями виявили лише ISSR-маркери. Найвищий рівень поліморфізму виявляли LP-PCR-маркери, але встановити популяційну приналежність усіх особин дозволили лише ISSR-маркери. Апробована система ПЛР-маркерів може бути застосована для моніторингу стану генофонду, вивчення генетичної структури популяцій та міграційних процесів.uk_UA
dc.description.abstractThe genetic polymorphism in Iris pumila L., a rare ornamental species involved in hybridization, was studied with PCR analysis using three types of primers: the first group was based on microsatellite repeats (ISSR), the second was complementary to the sequences of transposable elements (IRAP and iPBS), and the third - to the genes of abiotic stress response (LP-PCR). The high levels of intraspecific and intrapopulation genetic polymorphism were revealed for I. pumila, whose indices appeared to be comparable to other species of this genus. The main indices of genetic polymorphism were determined for five populations of I. pumila from the territory of Ukraine: the percentage of polymorphic loci (P) was 26,5—68,5 %, Shannon index (S) was 0.105 — 0,285, and gene diversity (Нг) was 0,069-0,190. ISSR- analysis demonstrated the direct relationship between the level of variation and the size of population, whereas two other types of markers showed the negative correlation between these indices. The direct relationship between genetic and geographic distances between populations was found only using ISSR-markers. The highest level of genetic polymorphism was detected by LP-PCR-markers, while the population assignment of all the individual plants was possible only with ISSR-markers. The developed system of PCR-based markers can be used to monitor the gene pool further on, and to study the genetic structure of populations and migration.en_US
dc.identifier.citationБублик О. М. Рівень поліморфізму та диференціація популяцій Iris pumila L. за даними трьох типів ПЛР-маркерів / О. М. Бублик, І. Ю. Парнікоза, В. А. Кунах // Цитологія і генетика. - 2021. - Т. 55, № 1. - С. 42-54.uk_UA
dc.identifier.issn0564-3783
dc.identifier.urihttps://ekmair.ukma.edu.ua/handle/123456789/19794
dc.language.isoukuk_UA
dc.relation.sourceЦитологія і генетика.uk_UA
dc.statusfirst publisheduk_UA
dc.subjectIris pumila L.uk_UA
dc.subjectрідкісний видuk_UA
dc.subjectПЛР- аналізuk_UA
dc.subjectгенетичний поліморфізмuk_UA
dc.subjectгенетична структура популяційuk_UA
dc.subjectстаттяuk_UA
dc.titleРівень поліморфізму та диференціація популяцій Iris pumila L. за даними трьох типів ПЛР-маркерівuk_UA
dc.title.alternativeLevel of polymorphism and population defferentiation of Iris pumila L. according to three types of PCR markersen_US
dc.typeArticleuk_UA
Files
Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
Bublyk_Riven_polimorfizmu_ta_dyferentsiatsiia_populiatsii_Iris_pumila_L..pdf
Size:
1.1 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Download
License bundle
Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
7.54 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description:
Download
Collections
Кафедра екології