Хромосомоспецифічний мікросателітний аналіз інтрогресивних ліній пшениці м'якої, стійких до борошнистої роси
Loading...
Date
2019
Authors
Антонюк, Максим
Єфіменко, Тетяна
Наваліхіна, Анастасія
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Скриновано інтрогресивні лінії пшениці, стійкі до борошнистої роси, за мікросателітними (SSR) локусами з відомою хромосомною локалізацією на семи хромосомах субгеному D пшениці м’якої. Порівняльний мікросателітний аналіз спектрів ампліконів сорту Аврора, геномно-заміщених амфідиплоїдів Аврозис, Авродес, Авролата та інтрогресивних ліній показав відсутність геномної специфічності для більшості з використаних локусів. Усі вивчені інтрогресивні лінії стосовно реципієнтного генотипу Аврора характеризуються алельним поліморфізмом за різною кількістю мікросателітних локусів, локалізованих у всіх семи хромосомах субгеному D. Поліморфізм включає нові компоненти у спектрах ампліфікації, які відрізняються від компонентів спектрів як Аврори, так і геномно-заміщених амфідиплоїдів. За результатами аналізу зроблено припущення щодо можливого зв’язку генів стійкості з хромосомами гомеологічних груп 3 та 6 у лінії – похідних Авродесу, 1, 2, 3, 6 – похідних Авролати та групи 2 у похідних Аврозису.
Aim. Determine the chromosome localization of introgressions containing alien genes for resistance to powdery mildew transferred to the wheat genome from three Aegilops species: Ae. sharonensis, Ae. speltoides, and Ae. umbellulata. Methods. Comparative microsatellite analysis of amplicons’ spectra, derived from PCR with primers to SSR loci localized on seven chromosomes of wheat D subgenome. Results. Spectra of amplification of products with DNA of Aurora cultivar, genome substitution amphidiploids Aurosis, Aurodes and Aurolata, using primers to 44 microsatellite loci localized on seven chromosomes of common wheat D subgenome have been obtained. Absence of genome specificity has been determined for most of the analyzed loci. All the studied introgressive lines have been characterized by allele polymorphism for different number of microsatellite loci from all seven chromosomes of D subgenome. This polymorphism included new components in amplicons spectra, which have been different from components of Aurora and genome substituted amphidiploids. Heterozygous genotypes have been also observed. A part of polymorphic loci has been uninformative because the chromosome of genome substituted amphidiploid had null-allele for such loci. For specification of the information about homeological identity of alien chromatin in resistant lines, genes of morphological traits with known chromosome localization have been used. Conclusions. Screening of resistant to powdery mildew wheat introgressive lines for microsatellite loci does not allow an unambiguous identification of chromosome localization of resistance gene because of high polymorphism of microsatellite loci in the genomes of introgressive lines, and because many loci are non-informative. Assumptions have been made about possible connections of resistance genes with chromosomes of homeological groups 3 and 6 in lines derived from Aurodes; 1, 2, 3, and 6 – in lines derived from Aurolata; and homeological group 2 in lines derived from Aurosis.
Aim. Determine the chromosome localization of introgressions containing alien genes for resistance to powdery mildew transferred to the wheat genome from three Aegilops species: Ae. sharonensis, Ae. speltoides, and Ae. umbellulata. Methods. Comparative microsatellite analysis of amplicons’ spectra, derived from PCR with primers to SSR loci localized on seven chromosomes of wheat D subgenome. Results. Spectra of amplification of products with DNA of Aurora cultivar, genome substitution amphidiploids Aurosis, Aurodes and Aurolata, using primers to 44 microsatellite loci localized on seven chromosomes of common wheat D subgenome have been obtained. Absence of genome specificity has been determined for most of the analyzed loci. All the studied introgressive lines have been characterized by allele polymorphism for different number of microsatellite loci from all seven chromosomes of D subgenome. This polymorphism included new components in amplicons spectra, which have been different from components of Aurora and genome substituted amphidiploids. Heterozygous genotypes have been also observed. A part of polymorphic loci has been uninformative because the chromosome of genome substituted amphidiploid had null-allele for such loci. For specification of the information about homeological identity of alien chromatin in resistant lines, genes of morphological traits with known chromosome localization have been used. Conclusions. Screening of resistant to powdery mildew wheat introgressive lines for microsatellite loci does not allow an unambiguous identification of chromosome localization of resistance gene because of high polymorphism of microsatellite loci in the genomes of introgressive lines, and because many loci are non-informative. Assumptions have been made about possible connections of resistance genes with chromosomes of homeological groups 3 and 6 in lines derived from Aurodes; 1, 2, 3, and 6 – in lines derived from Aurolata; and homeological group 2 in lines derived from Aurosis.
Description
Keywords
пшениця м’яка, інтрогресивні лінії, види егілопсів, борошниста роса, мікросателітний аналіз, стаття, common wheat, introgressive lines, Aegilops species, powdery mildew, microsatellite analysis
Citation
Антонюк М. З. Хромосомоспецифічний мікросателітний аналіз інтрогресивних ліній пшениці м'якої, стійких до борошнистої роси / Антонюк М. З., Єфіменко Т. С., Наваліхіна А. Г. // Наукові записки НаУКМА. Біологія і екологія. - 2019. - Т. 2. - С. 3-12.