Виявлення метилювання генів VIM, TMEFF2 і GDF15 у сечі пацієнтів, хворих на рак сечового міхура, в українській популяції

Маньковська, Оксана; Скрипнікова, О.; Панасенко, Г.; Вікарчук, М.; Кононенко, О.; Стаховський, Е.; Кашуба, В.

dc.contributor.author	Маньковська, Оксана
dc.contributor.author	Скрипнікова, О.
dc.contributor.author	Панасенко, Г.
dc.contributor.author	Вікарчук, М.
dc.contributor.author	Кононенко, О.
dc.contributor.author	Стаховський, Е.
dc.contributor.author	Кашуба, В.
dc.date.accessioned	2016-11-17T06:56:59Z
dc.date.available	2016-11-17T06:56:59Z
dc.date.issued	2016
dc.identifier.citation	Виявлення метилювання генів VIM, TMEFF2 і GDF15 у сечі пацієнтів, хворих на рак сечового міхура, в українській популяції / Маньковська О. С., Скрипнікова О. C., Панасенко Г. В., Вікарчук М. В., Кононенко О. А., Стаховський Е. О., Кашуба В. І. // Наукові записки НаУКМА : Біологія та екологія. - 2016. - Т. 184. - С. 23-29.	uk
dc.identifier.uri	http://ekmair.ukma.edu.ua/handle/123456789/9819
dc.description	Bladder cancer is one of the most common cancers in Ukraine and in the world, and the problem of its early diagnosis is still unresolved. The use of epigenetic markers, namely, the detection of tumor suppressor genes methylation, is a promising tool to assess the risks of the disease and its early detection, but it has a population features. The aim of this study was to test whether methylation of genes GDF15, TMEFF2 and VIM appears in the urine of patients with bladder cancer in the Ukrainian population, and evaluate the potential of this combination of methylated genes as tumor markers. We collected urine from patients with bladder (sample size is n = 42) and used urine samples from 5 healthy people as negative control. DNA was precipitated by CTAB and isolated by using a standard phenol/ chloroform/isopropanol approach. The presence of methylation of VIM, TMEFF2 and GDF15 promoters was detected by Real-Time MSP PCR after the procedure of DNA bisulfite conversion. We found the presence of hypermethylation of all 3 genes among the studied patients (n = 42), while none was detected in samples taken from healthy people (n = 5). The sensitivity of this potential combination of markers was 69 %, with specificity of 100 %. Correspondence between tumor stage and presence or absence of any of the studied markers has not been identified. It was concluded that there is a necessity to increase the sample size and to test the capability of GDF15, TMEFF2 and VIM to distinguish between bladder cancer and other onco-urological diseases.	en
dc.description.abstract	Рак сечового міхура є одним із найпоширеніших в Україні та світі, проблема його ранньої діагностики досі є нерозв’язаною. Використання епігенетичних маркерів, а саме виявлення метилування генів-онкосупресорів, є перспективним засобом для оцінки ризиків цього захворювання і раннього його виявлення, проте має популяційні особливості. Метою цієї роботи було перевірити, чи виявляється метилування генів GDF15, TMEFF2 і VIM у сечі хворих на рак сечового міхура в українській популяції і чи можна застосовувати цю комбінацію метильованих генів як інформативну панель онкомаркерів. Ми виявили наявність метилування усіх трьох генів серед досліджуваних хворих (n = 42), при цьому жоден не детектувався у нормі (n = 5). Чутливість цієї комбінації потенційних маркерів становила 69 %, специфічність – 100 %. Було зроблено висновок про необхідність розширення вибірки і перевірки диференціювальної здатості GDF15, TMEFF2 і VIM для раку сечового міхура порівняно з іншими онкоурологічними патологіями.	uk
dc.language.iso	uk	uk
dc.subject	метилування	uk
dc.subject	гени-онкосупресори	uk
dc.subject	рак сечового міхура	uk
dc.subject	рання діагностика	uk
dc.subject	онкомаркери	uk
dc.subject	GDF15	en
dc.subject	TMEFF2	en
dc.subject	VIM	en
dc.subject	methylation	en
dc.subject	tumor suppressor genes	en
dc.subject	bladder cancer	en
dc.subject	early diagnosis	en
dc.subject	tumor markers	en
dc.title	Виявлення метилювання генів VIM, TMEFF2 і GDF15 у сечі пацієнтів, хворих на рак сечового міхура, в українській популяції	uk
dc.title.alternative	Detection of methylation of VIM, TMEFF2 and GDF15 in the urine of patient with bladder cancer in Ukrainian population	en
dc.type	Article	uk
dc.status	published earlier	uk
dc.relation.source	Наукові записки НаУКМА: Біологія та екологія	uk